În viitorul îndepărtat, oamenii de știință au dezvoltat o navă în miniatură specială cu care a fost posibil să distrugă diverse tipuri de viruși. Tu în jocul Virus Hunter îl vei controla. Înainte de a vedea pe ecran, vei vedea corpul uman în interiorul căruia va fi amplasată această unitate. El va zbura înainte înainte câștigând treptat viteză. Pe drum vor apărea diverse bacterii. Va trebui să trageți cu precizie de la instrumente speciale pentru a cădea în aceste bacterii și astfel să le distrugeți.