În a treia parte a jocului Sonic Advance 3, îl vei ajuta în continuare pe curajosul Sonic și prietenii săi să lupte împotriva nebunului Dr. Evil. Nebunul vrea să construiască un oraș întreg în care să crească monștri. Pentru a face acest lucru, va avea nevoie de pietrele haosului. Sonic trebuie să le găsească mai întâi. În fața dvs. pe ecran va fi vizibil pentru personajul dvs. și însoțitorul său. Folosind tastele de control, vei controla acțiunile ambilor eroi simultan. Va trebui să-i faci să se miște prin locație și să inspectezi totul cu atenție. Căutați pietre și obiecte împrăștiate peste tot și colectați-le. Pe drumul tău vei întâlni obstacole și capcane peste care eroii tăi vor trebui să sară. Dacă întâlnesc monștri, atunci personajele vor putea să-i ocolească sau să-i distrugă alăturându-se la luptă. Pentru uciderea adversarilor, vi se vor acorda puncte în Sonic Advance 3.
