Un băiat pe nume Jack este un huligan cunoscut din oraș care pictează în mod constant zidurile clădirilor orașului. Odată ajuns la gară și a început să picteze un alt tablou acolo. Pentru aceasta a fost prins de un polițist și acum tipul nostru va trebui să fugă de el. În Rail Runner, îl vei ajuta pe Jack în această aventură. În fața ta pe ecran vei vedea personajul tău, care va alerga de-a lungul căilor ferate câștigând treptat viteză. Diverse obstacole vor apărea pe drumul său. Când eroul tău se află lângă unul dintre obstacole, va trebui să folosești anumite taste de control. Atunci eroul tău va sări și va zbura peste acest obstacol. Dacă nu ai timp să reacționezi, el se va izbi de ea pe fugă și se va răni.