Călătorind în jurul lumii, Naruto a căzut accidental într-un portal care l-a dus în lumea umbrelor. Acum, eroul nostru va trebui să-și găsească drumul spre casă. Tu în jocul Naruto Shadow Adventures îl vei ajuta cu asta. Folosind tastele de control, îl vei forța pe eroul să avanseze prin zonă. Pe drum, el va depăși diverse obstacole și capcane. Peste tot vor fi împrăștiate monede și alte obiecte pe care eroul tău va trebui să le colecteze. Dacă dai peste locuitorii acestei lumi, stickmen-uri din umbră, va trebui să te lupți cu ei. Controlând acțiunile lui Naruto, vei lovi inamicul. Distrugând inamicii, vei primi puncte și vei ridica trofeele care vor cădea din el.