În Ben 10: Brains vs Bugs va trebui să ajuți un extraterestru amuzant verde să-și elibereze prietenii răpiți. În fața ta, personajul tău va fi vizibil pe ecran, care va fi situat într-o anumită locație. Folosind tastele de control îi vei ghida acțiunile. Eroul tău va trebui să meargă pe un anumit traseu, depășind diverse capcane și alte pericole. Pe drum, el va colecta monede de aur și alte obiecte utile care îți vor aduce puncte în jocul Ben 10: Brains vs Bugs și poate oferi personajului diverse tipuri de bonusuri. De asemenea, personajul tău va trebui să lupte cu insectele care vor apărea în drumul său.
