Fructele din Fruit Ninja nu sunt menite să fie consumate ca salate sau doar pentru distracție. O grămadă de fructe au fost adunate de eroul jocului ninja, pentru a nu-și pierde abilitățile cu o sabie katana. Eroul lucrează ca bucătar într-o cafenea, în urmă cu câțiva ani și-a părăsit țara natală nu de bunăvoie, ci ascunzându-se de mafia locală. Dar mâinile mafiei sunt lungi și îl pot găsi oricând, ceea ce înseamnă că trebuie să fii pregătit și este nevoie de pregătire. Și din moment ce nu există echipamente sportive speciale la îndemână, va trebui să folosiți fructe. Asistentul va arunca pepeni verzi, banane, mere, kiwi și alte fructe, iar tu le vei tăia în Fruit Ninja.
