La fiecare nivel, în fața ta vor apărea câțiva eroi de niveluri complet diferite. Aceștia ar putea fi băieți sau fete destul de obișnuiți, super-eroi și așa mai departe. La începutul Persona Runner veți vedea un participant din care trebuie să creați ceea ce vi s-a arătat înainte de alergare. Eroul trebuie să colecteze ceva care va crește culoarea roșie sau albastră pe scară. În primul rând, decideți ce culoare ar trebui să predomine și colectați doar ceea ce o face să crească. Dacă nivelul său la linia de sosire este mai mult de jumătate din scara deasupra capului eroului, vei finaliza nivelul. Iar umilul alergător se va transforma într-un erou genial în Persona Runner.