O echipă de cercetători curajoși a pornit într-o expediție spațială pentru a găsi civilizații prietenoase în Bubble Throw. În timpul zborului, o anumită substanță ostilă a intrat în navă, care este completată cu bule multicolore și amenință să captureze nava din interior. Eroii au aflat că pot lupta împotriva invaziei cu bile de aceeași culoare, aruncându-le și formând grupuri de trei sau mai multe identice pentru distrugerea ulterioară. Pentru a finaliza un nivel în Bubble Throw trebuie să obții numărul necesar de puncte. Există un total de cincizeci de niveluri în joc și complexitatea lor crește constant.
