Ursul Banjo, împreună cu sora lui, trăiește în adâncul pădurii. Într-o zi, caracterul nostru sa trezit și a constatat că sora lui mai mică lipsea. Acum, în jocul Banjo-Kazooie, îl vom ajuta să o găsească. Pentru ajutor, personajul nostru sa îndreptat spre păsările magice Kazue. După un ritual magic, ea a prins traseul și a zburat de-a lungul acestuia. Acum conduceți eroul va trebui să alerge după ea fără a cădea în urmă. Fii atent în modul în care vei avea capcane și tu conduci eroul va trebui să-i forțeze să sară peste ele. Uneori puteți întâlni diferite monștri agresivi și va trebui să le distrugeți.