Nu degeaba ninja nostru s-a epuizat cu antrenamente într-o mănăstire de munte înalt timp de mulți ani. Datorită lor, a devenit cel mai bun din afacerea sa, super rapid și super agil. Și acum soarta lumii în care vrea să trăiască depinde de abilitățile și abilitățile sale. Există o amenințare de explozie la o centrală nucleară. Este situat departe de zonele populate, dar dacă se produce o explozie, va avea o putere atât de mare încât nu va părea nimănui. Și din satul natal al eroului nu a mai rămas nici măcar o mână de cenușă. Trebuie să ajungeți la stație în câteva minute și să opriți reactorul. Se poate face totuși, dar pe lângă ninja, nimeni nu are viteza respectivă. Dar va trebui să alerge, ocolind multe obstacole și aici nu poți face fără a-l ajuta să finalizeze nivelurile înainte de expirarea timpului în jocul Nuclear Ninja.