Echipa de țestoase ale ninjelor are un inamic foarte serios. Numele lui este Savanti Romero. Acest ticălos a construit o mașină de timp și acum colectează monștri din toate lumile: trecutul și viitorul, pentru a le uni într-o armată uriașă uriașă. Eroii trebuie să interfereze cu planurile dușmanului. Pentru a face acest lucru, vor trebui să viziteze toate locurile în care intenționează să meargă și să neutralizeze pe oricine încearcă să-i revină. Mike, Raphael, Leo și Donald sunt pregătiți pentru călătorii periculoase. Trebuie să alegeți prima pereche de solicitanți, ei vor fi transferați în Egiptul antic. Acolo se vor întâlni cu mumii răi. Dracula și zombi îi așteaptă în alte locuri, nu mai puțin periculoase ale jocului Teenage Mutant Ninja Turtles Monsters Vs Mutants